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One of the studies used iPSCs to evaluate BEs, and the results show that employing BEs rather than nuclease-based HDR can improve the correction of disease-causing mutations. The increased editing frequency should make it easier to find clones that have the necessary change. Off-target editing of DNA and RNA is becoming an issue with Bes also and these side effects raise the danger of undesired modifications, and iPSCs may be especially sensitive, as expression changes caused by RNA cross-editing could result in the reduction of pluripotency and differentiation. Base editing is currently limited to single base alterations and only a few nucleotide changes are possible [73]. Both BE and PE are only for short-term usage and cannot guarantee a lower off-target effect, hence further studies could lead to their potential role in therapeutics.
Continued genomic modification increases the likelihood of off-target cleavage and reduces editing selectivity, potentially leading to undesired mutations and toxicity. Endonuclease-induced off-target events should be reduced when using CRISPR-Cas9 in vivo since indel creation at undesired loci can impact cell viability or promote cancer [5]. The off-target cleavage sites from the gRNA/SpCas9 endonuclease ribonucleoprotein (RNP) system were first found in vitro on genomic DNA isolated from an animal model. The verification of in vivo off-targets approach has shown that the developed gRNAs are highly unlikely to cause off-target effects. But it is better to go for bioinformatics before in vivo and in vitro since bioinformatic pipelines and web-based algorithms are available for CRISPR/Cas systems to provide recommendations for optimal guide RNA (gRNA) design, reducing predictable off-target actions [14, 16]. 153554b96e
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